「比較的遠くの・・・」と言ってもどのくらい遠いのか、ですね。
自分の経験では、バハマに行く予定だったのが、ハリケーンの襲来でダメになったことがあります。
出発前日に連絡があり、飛行機でクルーズ乗船地の町までは行けるけど海には出れない、という状況でした。

そのバハマのときは、旅行代理店の親しい担当者が最大限の配慮をしてくれて、ハリケーンの影響がなさそうなラパスに行き先を変更してくれました。
　
通常、旅行約款上では悪天候や災害などは主催者・代理店の責任は無いので、自分でリスクを負うことになります。あとは、主催者・代理店がどのくらい気を利かせてくれるか、でしょうね。

↓ご参考まで。
http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q1128570471

代替えポイントを選択するなり、何らかの手は尽くします。
皆様のせっかくのお休みですから。

それを無駄にはしたくありませんので。

そのために、先読み先読み。
読みすぎて、何も問題なかった！何てこともあるんですが（笑）。

それくらいが大切な事ですね。

soltさん、こんにちは。

せっかくダイビングにいく為にスケジュールを空けているのに、天候や海況不良で一日を不意にしてしまうのは残念ですよね。

ご質問の回答ですが、代替地の手配は難しくないと思います。
多くの場合、前日または当日に再度現地に確認して、それから出発するので、代替えは可能だと思います。

ただ、当初目的にしていた方面にもよって、移動が困難であったりする場合があるので、その場合は残念ですが、ご手配が出来ない事もあるかと思います。

僕の場合は、代替えはもちろん、宿泊ツアーで海況不良にあたってしまった場合は、陸上で出来るSPコースを開催したりすることもあります。
台風や海況が悪い場合は、たとえポイントが潜水可能でも濁っていると、ただ潜るだけになってしまい面白みに欠けてしまう事があるので、皆さんと相談して潜るようにしてます。